На відміну від еукаріотичних клітин рибосоми бактерій не об’єднані в ендоплазматичну сітку. До складу рибосом входять рибосомні РНК (рРНК) – консервативні елементи бактерій (“молекулярний годинник” еволюції). 16S рРНК входить до складу малої субодиниці рибосом, а 23S рРНК – до складу великої субодиниці рибосом.

Основна відмінність прокаріотів та еукаріотів полягає в тому, що в клітинах прокаріотів генетичний матеріал осідає безпосередньо в цитоплазмі й представлений нуклеоїдом, який містить найчастіше замкнуту в кільце молекулу ДНК. В еукаріотів генетичний матеріал відокремлений ядерною оболонкою і, відповідно, укладений у ядрі.

Цитоплазматичні рибосоми еукаріотів більші, їх називають 80S-рибосомами (константа їхньої сегментації дорівнює 80 S). Рибосоми бактерій утворені двома субодиницями – 30S і 50S. За величиною та іншими особливостями рибосоми бактерій дещо подібні до рибосом мітохондрій і хлоропластів.